エクストラモンスターゾーンに相手の「星輝士 セイクリッド・ダイヤ」が表側表示で存在し、『①：X素材を持ったこのカードがモンスターゾーンに存在する限り、お互いにデッキからカードを墓地へ送る事はできず、墓地から手札に戻るカードは手札に戻らず除外される』効果が適用されています。

この時、自分のフィールドゾーンには「天空の聖域」が表側表示で存在し、自分のモンスターゾーンには「天空賢者ミネルヴァ」が表側表示で存在している場合、自分がカウンター罠カードを発動した際の「天空賢者ミネルヴァ」の『①：このカードがモンスターゾーンに存在する限り、自分または相手がカウンター罠カードを発動する度に、このカードの攻撃力は５００アップし、フィールドに「天空の聖域」が存在する場合、さらにその発動したカウンター罠カードとカード名が異なるカウンター罠カード１枚を自分の墓地から選んで手札に加える』モンスター効果の処理はどうなりますか？

「天空の聖域」の適用中に自分がカウンター罠カードを発動し、「天空賢者ミネルヴァ」のモンスター効果は適用された場合には、『このカードの攻撃力は５００アップし』の処理と、『さらにその発動したカウンター罠カードとカード名が異なるカウンター罠カード１枚を自分の墓地から選んで手札に加える』処理の両方が必ず適用される事になります。

質問の状況の場合、「天空賢者ミネルヴァ」の攻撃力をアップする処理は通常通り適用されますが、墓地から選んだカウンター罠カードは、相手の「星輝士 セイクリッド・ダイヤ」のモンスター効果が適用されていますので、手札には戻らず除外される事になります。