「ネフティスの護り手」の②の『デッキから「ネフティスの護り手」以外の「ネフティス」モンスター１体を選んで破壊する』効果が発動した時、チェーンして「灰流うらら」の効果を発動できますか？

発動できません。

破壊されたカードは結果的に墓地へ送られますが、この効果そのものは『●デッキからカードを墓地へ送る効果』とみなしません。そのため、例えば「星輝士 セイクリッド・ダイヤ」や「次元要塞兵器」の『お互いにデッキからカードを墓地へ送る事はできない』効果が適用されている状況でも、「ネフティスの護り手」の②の効果の発動や処理を行うことができます。

デッキに存在するカードを破壊する効果の例として、以下の効果が挙げられます。
「悪のデッキ破壊ウイルス」
「死のデッキ破壊ウイルス」
「連鎖破壊」
「ネフティスの繋ぎ手」②
「聖炎王 ガルドニクス」②
「ナイトメア・スローン」①
（ただし、『●攻撃力と守備力が０の悪魔族モンスター１体をデッキから選び、手札に加えるか破壊する』効果には『●デッキからカードを手札に加える効果』が含まれていますので、「灰流うらら」の効果をチェーンして発動できます。）