「Jo－P.U.N.K.ナシワリ・サプライズ」の『相手フィールドにセットされたカード１枚を対象として発動できる。そのカードを破壊する。自分フィールドに「P.U.N.K.」モンスターが存在する場合、代わりに相手フィールドの表側表示のカード１枚を対象とする事もできる』効果を発動し、自分フィールドに「P.U.N.K.」モンスターが存在する状態だったため相手フィールドの表側表示のカードを対象とました。

その効果処理時に、別のカードの効果によって自分フィールドに「P.U.N.K.」モンスターが存在しなくなった場合、対象のカードを破壊する処理は行えますか？

その場合でも、対象のカードを破壊する処理は行われます。

（『自分フィールドに「P.U.N.K.」モンスターが存在する場合』は、対象とするカードを選択する際の条件であり、処理を行うための条件ではありません。）