相手の魔法＆罠ゾーンに「オルターガイスト・プロトコル」が表側表示で存在する状態で、相手が「オルターガイスト・マリオネッター」の『①：このカードが召喚に成功した時に発動できる。デッキから「オルターガイスト」罠カード１枚を選んで自分の魔法＆罠ゾーンにセットする』モンスター効果を発動しました。

この時、自分が「くず鉄のシグナル」の『①：Sモンスターを素材として必要とするSモンスターが自分フィールドに存在し、相手がモンスターの効果を発動した時に発動できる。その発動を無効にする。発動後このカードは墓地へ送らず、そのままセットする』効果を発動した場合、「くず鉄のシグナル」のカードはどうなりますか？

質問の状況の場合、相手の「オルターガイスト・プロトコル」の『①：このカードが魔法＆罠ゾーンに存在する限り、自分フィールドの「オルターガイスト」カードの効果の発動及びその発動した効果は無効化されない』効果が適用されていますので、相手が発動した「オルターガイスト・マリオネッター」のモンスター効果は、「くず鉄のシグナル」によって発動が無効になる事はありません。

その場合でも、「くず鉄のシグナル」の発動は行われていますので、『発動後このカードは墓地へ送らず、そのままセットする』処理は適用され、「くず鉄のシグナル」は再び魔法＆罠ゾーンにセットされた状態になります。