自身の『①：このカードが手札・墓地に存在する場合、LPを半分払い、自分フィールドのレベル６以下のモンスター１体を対象として発動できる。このカードを特殊召喚する。この効果で特殊召喚したこのカードは、レベルが対象のモンスターのレベル分だけ下がり、フィールドから離れた場合に持ち主のデッキの一番下に戻る』モンスター効果で特殊召喚された「亡龍の戦慄－デストルドー」のモンスター効果が相手のモンスターゾーンに表側守備表示で存在し、方界カウンターが置かれています。

その後、「方界縁起」の『②：墓地のこのカードを除外し、自分フィールドの「方界」モンスター１体を対象として発動できる。このターン、そのモンスターが戦闘で方界カウンターが置かれているモンスターを破壊する度に、その破壊されたモンスターの元々の攻撃力分のダメージを相手に与える』効果が適用されているモンスターの攻撃によって、その「亡龍の戦慄－デストルドー」が戦闘で破壊された場合、相手にダメージを与える処理はどうなりますか？

質問の状況の場合、自身のモンスター効果によって特殊召喚されている「亡龍の戦慄－デストルドー」は、戦闘で破壊されフィールドを離れる際に墓地へは送られず、持ち主のデッキの一番下に戻る事になりますが、「方界縁起」の効果が適用されているモンスターとの戦闘によって破壊されていますので、『このターン、そのモンスターが戦闘で方界カウンターが置かれているモンスターを破壊する度に、その破壊されたモンスターの元々の攻撃力分のダメージを相手に与える』処理は通常通り適用されます。
（相手は「亡龍の戦慄－デストルドー」の元々の攻撃力分となる、1000のダメージを受ける事になります。）