自分の魔法＆罠ゾーンに「マクロコスモス」が表側表示で存在し、『②：このカードが魔法＆罠ゾーンに存在する限り、墓地へ送られるカードは墓地へは行かず除外される』効果が適用されています。

この状況で、自分が「スターダスト・ドラゴン」の『①：フィールドのカードを破壊する魔法・罠・モンスターの効果が発動した時、このカードをリリースして発動できる。その発動を無効にし破壊する』モンスター効果を発動した場合、「スターダスト・ドラゴン」は墓地へ送られず除外されますが、一連の処理後に「星屑の願い」の『①：１ターンに１度、自分フィールドの「スターダスト」Sモンスターが自身の効果を発動するためにリリースされた場合、そのモンスター１体を対象として発動できる。そのモンスターを特殊召喚する。この効果の発動に対して、相手は魔法・罠・モンスターの効果を発動できない』効果を発動する事はできますか？

質問の状況のように、「マクロコスモス」の効果が適用されている事によって、自身のモンスター効果を発動するためにリリースされた「スターダスト・ドラゴン」が除外される場合でも、一連の処理後に「星屑の願い」の『①：１ターンに１度、自分フィールドの「スターダスト」Sモンスターが自身の効果を発動するためにリリースされた場合、そのモンスター１体を対象として発動できる。そのモンスターを特殊召喚する』効果を発動する事はできます。
（その場合、リリースされ除外された「スターダスト・ドラゴン」を対象として「星屑の願い」の効果を発動する事になります。）