相手の魔法＆罠ゾーンに「マクロコスモス」が表側表示で存在し、『②：このカードが魔法＆罠ゾーンに存在する限り、墓地へ送られるカードは墓地へは行かず除外される』効果が適用されています。

この状況で、自分の「孤高除獣」が戦闘または相手の効果によって破壊され、結果的に除外される場合、『②：このカードが戦闘または相手の効果で破壊された場合、除外されている自分のモンスター１体を対象として発動できる。そのモンスターを手札に加える』モンスター効果によって、「孤高除獣」自身を対象とする事はできますか？

質問の状況のように、戦闘または相手の効果によって破壊された「孤高除獣」が除外された際に『そのモンスターを手札に加える』モンスター効果を発動する場合、除外された「孤高除獣」自身を対象に選択する事もできます。