レベルが7の状態となっている「F.A.ハングオンマッハ」を対象として、「F.A.カーナビゲーター」の『①：このカードが手札・墓地に存在する場合、自分フィールドの元々のレベルより高いレベルを持つ「F.A.」モンスター１体を対象として発動できる。このカードを特殊召喚し、対象のモンスターのレベルをその元々のレベルとの差分だけ下げる。この効果で特殊召喚したこのカードのレベルはその差分の数値と同じになる』モンスター効果を発動しました。

これによって、「F.A.ハングオンマッハ」のレベルは4になり、特殊召喚された「F.A.カーナビゲーター」のレベルは3になっています。

その後、「スキルドレイン」が発動し、2体のモンスターの効果が無効化された場合、レベルはどうなりますか？

「F.A.カーナビゲーター」が自身のモンスター効果によって特殊召喚された後、「スキルドレイン」が発動し、そのモンスター効果が無効化された場合には、対象のモンスター（＝質問の状況の場合、「F.A.ハングオンマッハ」）の下がったレベルは適用されたままとなりますが、「F.A.カーナビゲーター」自身のレベルは元々のレベルの1に戻ります。