相手が攻撃力2500の「幻想の黒魔導師」で、自分のモンスターゾーンに表側攻撃表示で存在する攻撃力400の「サイバー・ドラゴン・コア」を攻撃しました。

そのダメージ計算時に相手がチェーン1として、「幻想の見習い魔導師」の『③：このカード以外の自分の魔法使い族・闇属性モンスターが相手モンスターと戦闘を行うダメージ計算時、手札・フィールドのこのカードを墓地へ送って発動できる。その自分のモンスターの攻撃力・守備力はそのダメージ計算時のみ２０００アップする』モンスター効果を発動しました。

この場合、自分は「パワー・ウォール」の『①：相手モンスターの攻撃によって自分が戦闘ダメージを受けるダメージ計算時に発動できる。その戦闘で発生する自分への戦闘ダメージが０になるように５００ダメージにつき１枚、自分のデッキの上からカードを墓地へ送る』効果を発動する事はできますか？

質問の状況の場合でも、「パワー・ウォール」を発動する事ができます。

その場合、「パワー・ウォール」の効果処理の際に、自分が受ける事になる戦闘ダメージの数値は2100の状態ですので、『その戦闘で発生する自分への戦闘ダメージが０になるように５００ダメージにつき１枚、自分のデッキの上からカードを墓地へ送る』処理によって、自分はデッキの上からカードを5枚墓地へ送ります。

次に、相手の「幻想の見習い魔導師」のモンスター効果が適用され、相手の「幻想の黒魔導師」の攻撃力・守備力が2000アップする事になりますが、「パワー・ウォール」の効果が適用されていますので、その戦闘で発生する自分への戦闘ダメージは0になります。
（「サイバー・ドラゴン・コア」は戦闘で破壊され墓地へ送られる事になります。）