「召喚獣エリュシオン」の『②：１ターンに１度、自分のフィールド・墓地の「召喚獣」モンスター１体を対象として発動できる。そのモンスター及びそのモンスターと同じ属性を持つ相手フィールドのモンスターを全て除外する。この効果は相手ターンでも発動できる』モンスター効果によって、自分のモンスターゾーンに表側表示で存在する「召喚獣メガラニカ」を対象としました。

その発動にチェーンして「月の書」が発動し、その「召喚獣メガラニカ」が裏側守備表示になっている場合、効果処理はどうなりますか？

質問の状況のように、「召喚獣エリュシオン」のモンスター効果の対象として選択したモンスターが効果処理時に裏側守備表示になっている場合でも、対象とした「召喚獣」と名のついたモンスター（＝質問の状況の場合、「召喚獣メガラニカ」）は除外される事になります。

質問の状況の場合、対象の「召喚獣メガラニカ」は裏側守備表示になっており、『そのモンスターと同じ属性を持つ相手フィールドのモンスターを全て除外する』処理を適用する事はできません。
（この場合、相手のモンスターゾーンに存在するモンスターが除外される事はありません。）