「底なし落とし穴」の『①：相手がモンスターの召喚・反転召喚・特殊召喚に成功した時に発動できる。そのモンスターを裏側守備表示にする。この効果で裏側守備表示になったモンスターは表示形式を変更できない』効果によって、相手が召喚した「魔サイの戦士」が裏側守備表示になりました。

その結果、「彼岸の悪鬼 ファーファレル」が『②：自分フィールドに「彼岸」モンスター以外のモンスターが存在する場合にこのカードは破壊される』モンスター効果が適用された事で破壊され墓地へ送られた際に、『③：このカードが墓地へ送られた場合、フィールドのモンスター１体を対象として発動できる。そのモンスターをエンドフェイズまで除外する』モンスター効果を発動し、その裏側守備表示になった「魔サイの戦士」を対象としました。

エンドフェイズに除外された「魔サイの戦士」がフィールドに戻った場合、以降は表示形式を変更できるようになりますか？

質問の状況の場合、「底なし落とし穴」の効果によって裏側守備表示になった「魔サイの戦士」は、「彼岸の悪鬼 ファーファレル」の効果によって除外され、「底なし落とし穴」の『この効果で裏側守備表示になったモンスターは表示形式を変更できない』効果が適用されていない状態となります。

したがって、エンドフェイズにフィールドに戻った「魔サイの戦士」は、以降、表示形式を変更する事ができるようになります。