自分のモンスターゾーンに「昇竜剣士マジェスターP」と「虚竜魔王アモルファクターP」が表側表示で存在し、相手の魔法＆罠ゾーンにセットされているカードが1枚存在しています。

この状況で自分が「真竜の目覚め」を発動した際に、相手がチェーンしてセットされている「強制脱出装置」を発動し、「虚竜魔王アモルファクターP」を対象としました。

この場合、「真竜の目覚め」の効果処理はどうなりますか？

質問の状況の場合、相手の発動した「強制脱出装置」の効果によって、「虚竜魔王アモルファクターP」は持ち主の手札に戻ります。

それによって、「真竜の目覚め」の効果処理時にフィールドに存在するカードは「昇竜剣士マジェスターP」、発動した「真竜の目覚め」と「強制脱出装置」となりますので、「真竜の目覚め」の『お互いのフィールドのカードを全て持ち主のデッキに戻す』処理によって持ち主デッキに戻すカードは「昇竜剣士マジェスターP」のみとなります。

「昇竜剣士マジェスターP」はエクシーズモンスターですので、持ち主のデッキではなく、持ち主のエクストラデッキに戻す事になりますが、この場合でも、『その後、デッキから「竜剣士」モンスターまたは「竜魔王」モンスター１体を召喚条件を無視して特殊召喚できる』処理を適用する事ができます。