自分のモンスターゾーンに4種類以上のエクシーズ素材を持ち、『●４種類以上：このカードは「超量」カード以外のカードの効果を受けない』効果を得ている「超量機神王グレート・マグナス」が表側表示で存在しています。

この状況で相手が「超量機獣マグナライガー」の『②：１ターンに１度、このカードのX素材を１つ取り除き、フィールドのモンスター１体を対象として発動できる。そのモンスターを破壊する。このカードが「超量士レッドレイヤー」をX素材としている場合、この効果は相手ターンでも発動できる』効果を発動した場合、その「超量機神王グレート・マグナス」は破壊されますか？

「超量機神王グレート・マグナス」は、4種類以上のエクシーズ素材を持ち、『●４種類以上：このカードは「超量」カード以外のカードの効果を受けない』効果を得ている場合でも、「超量」と名のついたカードの効果は通常通り受ける事になります。

したがって、質問の状況であれば、相手の「超量機獣マグナライガー」の効果によって、「超量機神王グレート・マグナス」は破壊されます。