「爆走軌道フライング・ペガサス」の『②：このカード以外の自分フィールドの表側表示モンスター１体を対象として発動できる。そのモンスターとこのカードのレベルは、その内の１体のレベルと同じになる。この効果を発動するターン、自分はXモンスターでしか攻撃宣言できない』モンスター効果を発動し、そのレベルを対象の「弾丸特急バレット・ライナー」と同じレベル10にしました。

その後、相手が「スキルドレイン」を発動し、『①：このカードが魔法＆罠ゾーンに存在する限り、フィールドの全ての表側表示モンスターの効果は無効化される』効果が適用された場合、そのレベルはどうなりますか？

質問の状況のように、「爆走軌道フライング・ペガサス」の『そのモンスターとこのカードのレベルは、その内の１体のレベルと同じになる』モンスター効果が適用された後、「スキルドレイン」の効果によってモンスター効果が無効化された場合でも、適用されたレベルが元に戻る事はありません。
（質問の状況の場合、「爆走軌道フライング・ペガサス」のレベルは10のままとなります。）