自分が「ウォーター・ドラゴン－クラスター」の『②：このカードをリリースして発動できる。手札・デッキから「ウォーター・ドラゴン」２体を召喚条件を無視して守備表示で特殊召喚する。この効果は相手ターンでも発動できる』モンスター効果を発動しました。

その発動にチェーンして、相手が「手札断殺」の『①：お互いのプレイヤーは手札を２枚墓地へ送る。その後、それぞれデッキから２枚ドローする』効果を発動し、自分の手札の「ウォーター・ドラゴン」が墓地へ送られました。

これによって、自分の手札・自分のデッキに「ウォーター・ドラゴン」が1体しか存在しなくなった場合、効果処理はどうなりますか？

「ウォーター・ドラゴン－クラスター」の『手札・デッキから「ウォーター・ドラゴン」２体を召喚条件を無視して守備表示で特殊召喚する』モンスター効果は、特殊召喚される2体のモンスターが自分の手札か自分のデッキに存在する状態でなければ効果処理は適用されません。

したがって、質問の状況の場合、「ウォーター・ドラゴン－クラスター」のモンスター効果は適用されず、「ウォーター・ドラゴン」は1体も特殊召喚されません。