「幻煌龍の天渦」の『①：自分フィールドの「幻煌龍 スパイラル」１体を対象として発動できる。そのモンスターが「幻煌龍」装備魔法カード３種類以上を装備した状態で、戦闘で相手の効果モンスター３体を破壊した時、自分はデュエルに勝利する』効果が適用されている「幻煌龍 スパイラル」が表側表示で存在しています。

その「幻煌龍 スパイラル」が「幻煌龍の螺旋突」「幻煌龍の螺旋絞」「幻煌龍の螺旋波」の3種類を装備した状態で、相手の効果モンスターを攻撃しました。

その時、相手が「王宮の勅命」を発動し、「幻煌龍 スパイラル」の装備している「幻煌龍の螺旋突」「幻煌龍の螺旋絞」「幻煌龍の螺旋波」の効果を無効にした状態で戦闘が行われた場合、相手の効果モンスター1体を戦闘で破壊した事になりますか？

質問の状況のように、「幻煌龍 スパイラル」に装備されている装備魔法カードの効果が「王宮の勅命」の効果で無効になっている場合でも、その3種類の装備魔法カードは「幻煌龍 スパイラル」に装備された状態のままですので、戦闘で相手の効果モンスターを破壊したのであれば、通常通り、相手の効果モンスター1体を戦闘で破壊した扱いとなります。
（これによって、その「幻煌龍 スパイラル」が戦闘で破壊した効果モンスターが3体となったのであれば、「幻煌龍の天渦」の効果によって適用される勝利条件を満たす事になります。）