「エンプレス・オブ・エンディミオン」が特殊召喚に成功した際に、『①：このカードが特殊召喚に成功した場合、自分フィールドの他の魔力カウンターが置かれているカード１枚と相手フィールドのカード１枚を対象として発動できる。その自分及び相手のカードを持ち主の手札に戻す。その後、自分フィールドから手札に戻したカードに置かれていた数だけ魔力カウンターをこのカードに置く』モンスター効果を発動し、自分の魔法＆罠ゾーンに表側表示で存在し魔力カウンターが置かれている「漆黒のパワーストーン」と相手のモンスターゾーンに存在する裏側守備表示モンスターを対象としました。

その発動にチェーンして相手が「強制脱出装置」を発動し、「エンプレス・オブ・エンディミオン」自身が手札に戻り、フィールドに存在しなくなっている場合、効果処理はどうなりますか？

質問の状況のように、「エンプレス・オブ・エンディミオン」の『その自分及び相手のカードを持ち主の手札に戻す。その後、自分フィールドから手札に戻したカードに置かれていた数だけ魔力カウンターをこのカードに置く』モンスター効果の処理時に、効果を発動した「エンプレス・オブ・エンディミオン」自身がフィールドに存在しなくなっている場合には、『その自分及び相手のカードを持ち主の手札に戻す』処理は適用されますが、『その後、自分フィールドから手札に戻したカードに置かれていた数だけ魔力カウンターをこのカードに置く』処理は適用されません。
（対象のカードを手札に戻す処理にて処理が完了した扱いとなります。）