自分の「魔弾－ブラッディ・クラウン」の『②：自分・相手のメインフェイズに発動できる。手札から「魔弾」モンスター１体を特殊召喚する。この効果でモンスターが特殊召喚されたゾーンと同じ縦列の相手のメインモンスターゾーンが使用されていない場合、そのゾーンはターン終了時まで使用できない』効果によって、相手のメインモンスターゾーンの1ヵ所が使用できない状態となっているターンです。

その状況で、相手が発動した「サイクロン」の効果によって、自分の「魔弾－ブラッディ・クラウン」が破壊された場合、使用できない状態となっていた相手のメインモンスターゾーンは使用できるようになりますか？

「魔弾－ブラッディ・クラウン」の効果は、『手札から「魔弾」モンスター１体を特殊召喚する』処理が適用された際に、その縦列となる相手のメインモンスターゾーンが使用されていなかった場合、『そのゾーンはターン終了時まで使用できない』処理も同時に適用されます。

質問の状況のように、その後、「魔弾－ブラッディ・クラウン」が破壊されフィールドに存在しなくなった場合でも、『そのゾーンはターン終了時まで使用できない』処理は適用されたままとなります。