自分が「逢魔ノ妖刀－不知火」の『①：このカードをリリースし、「逢魔ノ妖刀－不知火」以外の除外されている自分のモンスターの中から「不知火」モンスターを含むアンデット族モンスター２体を対象として発動できる。そのモンスターを守備表示で特殊召喚する。この効果で特殊召喚したモンスターの効果は無効化される。この効果の発動後、ターン終了時まで自分はアンデット族モンスターしか特殊召喚できない』モンスター効果を発動し、除外されている「麗の魔妖－妲姫」と「不知火の武部」を対象としました。

その発動にチェーンして、相手が「異次元からの埋葬」を発動し、「不知火の武部」のみが墓地へ戻っている場合、効果処理はどうなりますか？

質問の状況のように、「逢魔ノ妖刀－不知火」のモンスター効果の処理時に、対象とした2体のモンスターの内、1体が除外されていない場合でも、対象に選択したもう1体のモンスターは特殊召喚される事になります。
（『この効果で特殊召喚したモンスターの効果は無効化される』処理、『この効果の発動後、ターン終了時まで自分はアンデット族モンスターしか特殊召喚できない』処理も適用されます。）