「F.A.オーバー・ヒート」の『①：相手フィールドにのみモンスターが存在する場合に発動できる。手札から「F.A.」モンスター１体を特殊召喚する。この効果で特殊召喚したモンスターのレベルはターン終了時まで３つ上がる』効果によって、手札の「F.A.ウィップクロッサー」を特殊召喚しました。

この場合、その「F.A.ウィップクロッサー」の『②：「F.A.」魔法・罠カードの効果が発動した場合に発動できる（ダメージステップでも発動可能）。このカードのレベルを１つ上げる』モンスター効果を発動する事はできますか？

「F.A.ウィップクロッサー」の『このカードのレベルを１つ上げる』モンスター効果は、「F.A..」と名のついた魔法・罠カードのカードの発動または効果の発動が行われた時点で、「F.A.ウィップクロッサー」自身がモンスターゾーンに表側表示で存在していなければ、発動条件を満たした事にはなりません。

質問の状況のように、発動した「F.A.オーバー・ヒート」の効果処理によって特殊召喚された「F.A.ウィップクロッサー」の『このカードのレベルを１つ上げる』モンスター効果を、その際に発動する事はできません。
（「F.A.ウィップクロッサー」が特殊召喚された以降に、新たな「F.A.」と名のついた魔法・罠カードのカードの発動または効果の発動が行われたのであれば、その際には「F.A.ウィップクロッサー」の『このカードのレベルを１つ上げる』モンスター効果を発動する事ができます。）