「死魂融合」の『①：自分の墓地から、融合モンスターカードによって決められた融合素材モンスターを裏側表示で除外し、その融合モンスター１体をEXデッキから融合召喚する。この効果で特殊召喚したモンスターはこのターン攻撃できない』効果によって、自分の墓地から「クロック・ワイバーン」と「クロック・スパルトイ」を裏側表示で除外し、「サイバース・クロック・ドラゴン」を融合召喚しました。

この時、「サイバース・クロック・ドラゴン」の『①：このカードの融合召喚成功時に発動できる。その素材のリンクマーカーの合計分だけ、自分のデッキの上からカードを墓地へ送る。次のターンの終了時まで、他の自分のモンスターは攻撃できず、このカードの攻撃力はこの効果で墓地へ送った数×１０００アップする』モンスター効果を発動する事はできますか？

「死魂融合」の効果によって融合素材となるリンクモンスターが裏側表示で除外される場合でも、「サイバース・クロック・ドラゴン」の『その素材のリンクマーカーの合計分だけ、自分のデッキの上からカードを墓地へ送る。次のターンの終了時まで、他の自分のモンスターは攻撃できず、このカードの攻撃力はこの効果で墓地へ送った数×１０００アップする』モンスター効果を発動する事ができます。
（質問の状況の場合、「クロック・スパルトイ」のリンクマーカーの数が2ですので、デッキの上からカード2枚墓地へ送ります。）

なお、「死魂融合」をチェーン2以降で発動している場合には、融合召喚に成功した「サイバース・クロック・ドラゴン」の『その素材のリンクマーカーの合計分だけ、自分のデッキの上からカードを墓地へ送る。次のターンの終了時まで、他の自分のモンスターは攻撃できず、このカードの攻撃力はこの効果で墓地へ送った数×１０００アップする』モンスター効果を発動する事はできません。