自分のモンスターゾーンに「トリックスター・シャクナージュ」が表側表示で存在しています。

この状況で、自分が「D.D.クロウ」の『①：このカードを手札から墓地へ捨て、相手の墓地のカード１枚を対象として発動できる。そのカードを除外する。この効果は相手ターンでも発動できる』モンスター効果を発動し、相手の墓地のカード1枚を除外しました。

この場合にも、「トリックスター・シャクナージュ」の『②：このカードがモンスターゾーンに存在する限り、相手の墓地からカードが除外される度に、その除外されたカードの数×２００ダメージを相手に与える』モンスター効果は適用されますか？

「トリックスター・シャクナージュ」の『相手の墓地からカードが除外される度に、その除外されたカードの数×２００ダメージを相手に与える』モンスター効果は、「トリックスター・シャクナージュ」のコントローラーから見て相手となるプレイヤーの墓地からカードが除外されたのであれば適用されます。

相手プレイヤーが自身のカードの効果などによって、墓地のカードを除外した場合だけでなく、質問の状況のように、自分の発動した「D.D.クロウ」のモンスター効果によって、相手の墓地のカードを除外した場合にも適用されます。