自分のモンスターゾーンに2体の「ファイヤークラッカー」が表側表示で存在し、自身の『②：このカードがモンスターゾーンに存在する限り、相手が効果ダメージを受ける度にこのカードにカウンターを１つ置く』モンスター効果によって置かれたカウンターが2つある状態です。

この状況で、それぞれの「ファイヤークラッカー」の『③：自分・相手のエンドフェイズに発動する。このカードのカウンターを全て取り除き、その数×３００ダメージを相手に与える』モンスター効果はどのように発動と処理を行いますか？

自分のモンスターゾーンに「ファイヤークラッカー」が2体存在する場合、それぞれの「ファイヤークラッカー」のモンスター効果はチェーンではなく、別々に発動と処理を行う事になります。

質問の状況の場合、まず、1体目の「ファイヤークラッカー」のモンスター効果を発動し、その効果処理によってカウンターが2つ取り除かれ、相手に600のダメージを与えます。
（このダメージによって、『②：このカードがモンスターゾーンに存在する限り、相手が効果ダメージを受ける度にこのカードにカウンターを１つ置く』モンスター効果が適用され、それぞれの「ファイヤークラッカー」にカウンターが1つ置かれます。）

次に、2体目の「ファイヤークラッカー」のモンスター効果を発動し、その効果処理によってカウンターが3つ取り除かれ、相手に900のダメージを与えます。
（このダメージによって、『②：このカードがモンスターゾーンに存在する限り、相手が効果ダメージを受ける度にこのカードにカウンターを１つ置く』モンスター効果が適用され、それぞれの「ファイヤークラッカー」にカウンターが1つ置かれます。）

結果的に、この場合、カウンターが1つ置かれた「ファイヤークラッカー」とカウンターが2つ置かれた「ファイヤークラッカー」が存在する状態で、そのターンを終える事になります。