自身の『①：自分・相手のメインフェイズに発動できる。このカードは発動後、通常モンスター（爬虫類族・地・星４・攻１６００／守１８００）となり、モンスターゾーンに特殊召喚する。このカードは罠カードとしても扱う』効果によってモンスターカードとして扱われている「アポピスの化神」が、「No.59 背反の料理人」の『②：１ターンに１度、このカードのX素材を１つ取り除いて発動できる。このカード以外の自分フィールドのカードを全て破壊する。その後、このカードの攻撃力はターン終了時まで、この効果で破壊され墓地へ送られたモンスターの数×３００アップする。この効果は相手ターンでも発動できる』モンスター効果によって破壊されました。

その場合、攻撃力はアップしますか？

質問の状況のように、フィールドにてモンスターカードとして扱われている「アポピスの化神」が「No.59 背反の料理人」のモンスター効果によって破壊され墓地へ送られた場合、「No.59 背反の料理人」の攻撃力はアップしません。
（墓地へ送られた「アポピスの化神」はモンスターカードとしては扱われません。）