「EMドラネコの『①：１ターンに１度、自分のモンスターが相手モンスターと戦闘を行う攻撃宣言時に発動できる。その戦闘で発生する自分への戦闘ダメージは０になる』モンスター効果を適用している相手のターンのバトルステップにて戦闘の巻き戻しが発生しました。

この時、『その戦闘で発生する自分への戦闘ダメージは０になる』モンスター効果はどうなりますか？

質問の状況の場合、相手のモンスターゾーンに存在するモンスターが攻撃モンスターとなりますので、攻撃対象を相手が選び直す事になります。

その戦闘の巻き戻しの結果、相手のモンスターが攻撃対象を選び直し、攻撃を続行するのであれば、『その戦闘で発生する自分への戦闘ダメージは０になる』モンスター効果は適用されたまま、戦闘ダメージ計算が行われる事になります。

なお、その戦闘の巻き戻しの結果、相手が攻撃対象となるモンスターを選ばず、攻撃を取り止めた場合であれば、その戦闘は終了する事になりますので、『その戦闘で発生する自分への戦闘ダメージは０になる』モンスター効果の適用もなくなります。
（相手のモンスターが行う次の攻撃の際に、『その戦闘で発生する自分への戦闘ダメージは０になる』モンスター効果が再び適用される事もありません。）