相手のフィールドと相手の墓地にモンスターが1体も存在していない場合、自分は手札の「真竜皇アグニマズドV」の『①：自分メインフェイズに発動できる。このカード以外の手札及び自分フィールドの表側表示モンスターの中から、炎属性モンスターを含むモンスター２体を破壊し、このカードを手札から特殊召喚し、炎属性モンスター２体を破壊した場合、相手のフィールド・墓地からモンスター１体を選んで除外できる』モンスター効果を発動する事はできますか？

相手のフィールドと相手の墓地にモンスターが1体も存在していない場合でも、手札の「真竜皇アグニマズドV」のモンスター効果を発動する事はできます。

その場合、カードを除外する処理を適用する事はできませんので、『このカード以外の手札及び自分フィールドの表側表示モンスターの中から、炎属性モンスターを含むモンスター２体を破壊し、このカードを手札から特殊召喚し』の処理までを行い、処理を完了する事になります。
（炎属性モンスター2体を破壊して処理を行った場合でも、『相手のフィールド・墓地からモンスター１体を選んで除外できる』処理を適用する事はできません。）