「獣神ヴァルカン」と、ペンデュラム召喚によって特殊召喚されている「EMドクロバット・ジョーカー」が、それぞれ自分のモンスターゾーンに表側表示で存在しています。

その後、その「EMドクロバット・ジョーカー」が相手の発動した「彼岸の悪鬼 ファーファレル」の『③：このカードが墓地へ送られた場合、フィールドのモンスター１体を対象として発動できる。そのモンスターをエンドフェイズまで除外する』モンスター効果によって除外されました。

その後にフィールドに戻ったその「EMドクロバット・ジョーカー」を、『このカードをS召喚する場合、自分フィールドのP召喚したPモンスター１体をチューナーとして扱う事ができる』方法によって、「涅槃の超魔導剣士」をシンクロ召喚する場合にチューナーとして扱う事はできますか？

質問の状況の場合、ペンデュラム召喚によって特殊召喚された「EMドクロバット・ジョーカー」はエンドフェイズまで除外されますが、フィールドに戻った際に、ペンデュラム召喚によって特殊召喚されたモンスターとして引き続き扱われる事になります。

したがって、次のターンに「涅槃の超魔導剣士」をシンクロ召喚する場合に、その「EMドクロバット・ジョーカー」をチューナーとして扱う事はできます。