自身の『①：このカードが墓地に存在し、相手モンスターが攻撃した場合、そのダメージ計算時に１０００LPを払って発動できる。このカードを墓地から特殊召喚し、その戦闘で発生する自分への戦闘ダメージは０になる。この効果で特殊召喚したこのカードはフィールドから離れた場合に除外される』効果によって特殊召喚された「盾航戦車ステゴサイバー」がメインフェイズ2に、「月の書」の効果によって裏側守備表示になりました。

その後、その「盾航戦車ステゴサイバー」が「ブラック・ホール」の効果で破壊され、フィールドから離れる場合、除外される事になりますか？

自身の効果によって特殊召喚された「盾航戦車ステゴサイバー」がその後に裏側守備表示になった場合、『この効果で特殊召喚したこのカードはフィールドから離れた場合に除外される』効果の適用はなくなります。

したがって、質問の状況の場合、「ブラック・ホール」の効果によって破壊された、「盾航戦車ステゴサイバー」は除外される事はなく、墓地へ送られる事になります。