自分が「グレイドル・スプリット」の『②：自分メインフェイズに、このカードの効果で装備されているこのカードを墓地へ送って発動できる。このカードを装備していたモンスターを破壊し、デッキから「グレイドル」モンスター２体を特殊召喚する（同名カードは１枚まで）。この効果で特殊召喚したモンスターはエンドフェイズに破壊される』効果を発動しました。

その発動にチェーンして自分が「針虫の巣窟」を発動し、自分のデッキに「グレイドル」と名のついたモンスターが1種類しか存在しない状態になった場合、効果処理はどうなりますか？

質問の状況の場合でも、「グレイドル・スプリット」の『このカードを装備していたモンスターを破壊し』の処理は通常通り適用されますが、『デッキから「グレイドル」モンスター２体を特殊召喚する（同名カードは１枚まで）』処理を適用する事はできません。
（この場合、モンスターは1体も特殊召喚されません。）