「転生断絶」の『このカードがフィールド上に存在する限り、墓地からデッキに戻るカードはデッキに戻らずゲームから除外される』効果が適用されている場合、「金満な壺」を発動する事はできますか？

「転生断絶」の適用中であっても、「金満な壺」を発動する事はできます。

エクストラデッキの表側表示のペンデュラムモンスター３体をデッキに戻して効果処理を行う場合であれば、その処理は通常通り適用され、ドローする処理も行います。

なお、「金満な壺」の効果処理にて自分の墓地のペンデュラムモンスターを選んだ場合には、その墓地から選んだカードはデッキに戻らず除外されます。（エクストラデッキから選んだカードは通常通りデッキに戻します。）
この場合、合計３体をデッキに加える事ができていませんので、ドローする処理は適用されません。