「聖霊獣騎 ペトルフィン」の『②：このカードをエクストラデッキに戻し、除外されている自分の「霊獣使い」モンスター１体と「精霊獣」モンスター１体を対象として発動できる。そのモンスターを守備表示で特殊召喚する。この効果は相手ターンでも発動できる』効果を発動し、「霊獣使い ウェン」と「精霊獣 ペトルフィン」を対象としました。

その発動にチェーンして相手が「おジャマトリオ」を発動し、自分のモンスターゾーンの空きが１つになった場合、処理はどうなりますか？

「聖霊獣騎 ペトルフィン」の効果で除外されている「霊獣使い」と名のついたモンスターと「精霊獣」と名のついたモンスターを特殊召喚する効果は、モンスターゾーンに空きが１つもない場合には効果を発動する事自体ができません。
（「聖霊獣騎 ペトルフィン」自身をエクストラデッキに戻して効果を発動しますので、「聖霊獣騎 ペトルフィン」が存在していたモンスターゾーン以外に、モンスターゾーンが１つ以上空いている必要があります。）

なお、質問の状況のように、自分のモンスターゾーンの空きが１つしかない場合、どちらか１体を特殊召喚するモンスターとして選び、残りは墓地へ送られる事になります。
（例えば、「霊獣使い ウェン」を特殊召喚するモンスターとして選んだのであれば、もう１枚の対象である「精霊獣 ペトルフィン」は墓地へと送られる事になります。）