自分の「魔獣の懐柔」の発動にチェーンして、自分が「針虫の巣窟」を発動しました。

その結果、自分のデッキに「魔獣の懐柔」の効果で特殊召喚できる獣族モンスターが２体以下になった場合、「魔獣の懐柔」の処理はどうなりますか？

自分のデッキに「魔獣の懐柔」の効果によって特殊召喚可能な獣族モンスターが３体以上存在しないのであれば、「魔獣の懐柔」を発動する事自体ができません。

質問の状況の場合、効果処理時に、３体のモンスターを特殊召喚する事ができませんので、特殊召喚する処理は適用されません。（モンスターは１体も特殊召喚されず、デッキからモンスターを選ぶ事自体行いません。）

なお、その場合でも、『このカードの発動後、ターン終了時まで自分は獣族以外のモンスターを特殊召喚できない』処理は通常通り適用される事になります。