相手が「フレンドシップ」で、自分のモンスターゾーンに裏側守備表示で存在する「光霊使いライナ」を攻撃し、その戦闘の結果、どちらのモンスターも戦闘では破壊されず、ダメージ計算後にリバースした「光霊使いライナ」の『①：このカードがリバースした場合、相手フィールドの光属性モンスター１体を対象として発動する。このモンスターが表側表示で存在する間、そのモンスターのコントロールを得る』モンスター効果が発動し、対象とした相手の「フレンドシップ」のコントロールを得ました。

その後、メインフェイズ2に「スキルドレイン」が発動し、『①：このカードが魔法＆罠ゾーンに存在する限り、フィールドの全ての表側表示モンスターの効果は無効化される』効果が適用された場合、どうなりますか？

「光霊使いライナ」のモンスター効果は、自身がリバースした場合に発動する誘発効果です。

質問の状況の場合、発動した効果は既に処理が完了し、対象のモンスター（＝「フレンドシップ」）のコントロールを得ていますので、その後に「スキルドレイン」が発動し、「光霊使いライナ」のモンスター効果が無効化されたとしても、既に適用されている効果が無効化される事はありません。
（「光霊使いライナ」自身がモンスターゾーンに表側表示で存在する間は、対象のモンスターのコントロールは得た状態のままとなります。）