自分が発動した「ハーピィの羽根吹雪」の『①：自分フィールドに鳥獣族・風属性モンスターが存在する場合に発動できる。ターン終了時まで、相手が発動したモンスターの効果は無効化される』効果が適用されているターンです。

この状況で、相手が「禁じられた聖槍」の『①：フィールドの表側表示モンスター１体を対象として発動できる。そのモンスターはターン終了時まで、攻撃力が８００ダウンし、このカード以外の魔法・罠カードの効果を受けない』効果が適用されている状態の、「精霊獣 カンナホーク」の『①：１ターンに１度、自分メインフェイズに発動できる。デッキから「霊獣」カード１枚を除外する。発動後２回目の自分スタンバイフェイズに、この効果で除外したカードを手札に加える』モンスター効果を発動しました。

この場合、相手の「精霊獣 カンナホーク」のモンスター効果は無効化されますか？

質問の状況のように、モンスターゾーンに存在する相手モンスターがモンスター効果を発動した場合、適用されている「ハーピィの羽根吹雪」の効果は、そのモンスターゾーンに存在するモンスターが受ける効果となります。

したがって、質問の状況の場合、相手が発動した「精霊獣 カンナホーク」のモンスター効果は無効化されず、効果処理が通常通り適用される事になります。