自分のモンスターゾーンに存在するモンスターが「マグナヴァレット・ドラゴン」と「オートヴァレット・ドラゴン」のみという状況です。

自分はこの状況で「ラピッド・トリガー」の『①：融合モンスターカードによって決められた自分フィールドの融合素材モンスターを破壊し、その融合モンスター１体をEXデッキから融合召喚する。この効果で特殊召喚したモンスターはEXデッキから特殊召喚されたモンスターしか攻撃できず、EXデッキから特殊召喚された他のモンスターが発動した効果を受けない』効果を発動しました。

その発動にチェーンして、相手が「虚無空間」を発動した場合、処理はどうなりますか？

質問の状況の場合、「虚無空間」の『①：このカードが魔法＆罠ゾーンに存在する限り、お互いにモンスターを特殊召喚できない』効果が適用された状態で、「ラピッド・トリガー」の効果処理が行われる事になります。

この場合、特殊召喚を行う事ができませんので、融合素材モンスター一組を破壊する処理も行いません。
（「マグナヴァレット・ドラゴン」、「オートヴァレット・ドラゴン」、どちらも破壊されず、モンスターゾーンに残ります。）