「ローグ・オブ・エンディミオン」の『②：このカードの魔力カウンターを１つ取り除き、手札から魔法使い族モンスター１体を捨てて発動できる。デッキから永続魔法カード１枚を選んで自分の魔法＆罠ゾーンにセットする。このターン、自分はこの効果でセットしたカード及びその同名カードの効果を発動できない』モンスター効果によって、デッキから「真竜凰の使徒」を選び、自分の魔法＆罠ゾーンにセットしました。

そのターンに、その「真竜凰の使徒」が破壊され墓地へ送られた場合、自分はその「真竜凰の使徒」の『③：このカードが魔法＆罠ゾーンから墓地へ送られた場合、フィールドの魔法・罠カード１枚を対象として発動できる。そのカードを破壊する』効果を発動する事はできますか？

「ローグ・オブ・エンディミオン」の『デッキから永続魔法カード１枚を選んで自分の魔法＆罠ゾーンにセットする』モンスター効果によってデッキからセットした永続魔法カードとその同名のカードは、そのターンにカードの発動だけでなく、効果の発動を行う事ができません。

したがって、質問の状況の場合、「ローグ・オブ・エンディミオン」のモンスター効果によってデッキから魔法＆罠ゾーンにセットした「真竜凰の使徒」がそのターンに墓地へ送られた場合には、「真竜凰の使徒」の『そのカードを破壊する』効果を発動する事はできません。