「百雷のサンダー・ドラゴン」の『①：自分の墓地の雷族モンスター１体を対象として発動できる。そのモンスターを特殊召喚する。その後、その同名モンスターを自分の墓地から可能な限り特殊召喚できる。この効果で特殊召喚したモンスターは、フィールドから離れた場合に除外される。この効果で特殊召喚したモンスターがモンスターゾーンに存在する限り、自分は雷族モンスターしか特殊召喚できない』効果によって、自分の墓地から2体の「雷獣龍－サンダー・ドラゴン」を特殊召喚しました。

その後、その「雷獣龍－サンダー・ドラゴン」の内1体が、「月の書」の効果によって裏側守備表示になった場合、自分は雷族以外のモンスターを特殊召喚する事はできますか？

「百雷のサンダー・ドラゴン」の効果によって複数体のモンスターを特殊召喚した場合、その特殊召喚されたモンスターが1体でもモンスターゾーンに表側表示で存在している間は、『この効果で特殊召喚したモンスターがモンスターゾーンに存在する限り、自分は雷族モンスターしか特殊召喚できない』効果が適用されたままとなります。

質問の状況のように、「百雷のサンダー・ドラゴン」の効果で特殊召喚されたモンスター2体の内、1体のみが裏側守備表示になっている場合には、自分は雷族以外のモンスターを特殊召喚する事ができない状態のままとなります。
（その後、もう1体の「雷獣龍－サンダー・ドラゴン」も裏側守備表示になる等によって、モンスターゾーンに表側表示で存在しなくなった場合には、自分は雷族以外のモンスターを特殊召喚する事ができるようになります。）