自分が「竜魔導の守護者」の『②：EXデッキの融合モンスター１体を相手に見せて発動できる。そのモンスターにカード名が記されている融合素材モンスター１体を自分の墓地から選んで裏側守備表示で特殊召喚する』モンスター効果を発動する際に、コストとして、エクストラデッキの「竜騎士ガイア」を相手に見せました。

その発動にチェーンして、相手が「エクストラゲート」の『１から１２までの任意のレベルを宣言して発動する。相手はエクストラデッキに存在する宣言されたレベルを持つモンスター１体をゲームから除外する。宣言したレベルを持つモンスターが相手のエクストラデッキに無かった場合、自分の手札を１枚選択して捨てる』効果を発動した事によって、エクストラデッキに「竜騎士ガイア」が存在しなくなった場合、処理はどうなりますか？

「竜魔導の守護者」のモンスター効果を発動する際に、コストとして見せたエクストラデッキの融合モンスターが効果処理時にエクストラデッキに存在しなくなっている場合でも、効果処理は通常通り適用されます。

質問の状況の場合、「竜騎士ガイア」を見せて発動していますので、自分の墓地から「暗黒騎士ガイア」または「カース・オブ・ドラゴン」1体を選んで裏側守備表示で特殊召喚する事になります。