「ガガガマンサー」が「No.39 希望皇ホープ」のエクシーズ素材となっています。

その「ガガガマンサー」を取り除いて「No.39 希望皇ホープ」の攻撃を無効にする効果を発動した場合、「ガガガマンサー」の『②：X素材のこのカードがXモンスターの効果を発動するために取り除かれ墓地へ送られた場合、自分フィールドのXモンスター１体を対象として発動できる。そのモンスターの攻撃力はターン終了時まで５００アップする』効果はいつ発動しますか？

「ガガガマンサー」の『②：X素材のこのカードがXモンスターの効果を発動するために取り除かれ墓地へ送られた場合、自分フィールドのXモンスター１体を対象として発動できる。そのモンスターの攻撃力はターン終了時まで５００アップする』効果は、エクシーズ素材となっている状態から、エクシーズモンスターが効果を発動するために取り除かれ墓地へ送られた場合、その効果の処理後に発動する事ができる効果です。

したがって、質問の状況の場合、「ガガガマンサー」の効果は、「No.39 希望皇ホープ」の効果によって攻撃が無効になった後に、チェーン１として改めて発動する事になります。
（「No.39 希望皇ホープ」の効果にチェーンして発動する効果ではありません。）