「The despair URANUS」が自分のモンスターゾーンに表側表示で存在し、『③：このカードがモンスターゾーンに存在する限り、自分の魔法＆罠ゾーンの表側表示のカードは効果では破壊されない』モンスター効果が適用されている場合、自身の『①：自分・相手のメインフェイズに発動できる。このカードは発動後、通常モンスター（爬虫類族・地・星４・攻１６００／守１８００）となり、モンスターゾーンに特殊召喚する。このカードは罠カードとしても扱う』効果によってモンスターカードとして扱われている「アポピスの化神」はカードの効果によって破壊されなくなりますか？

発動後、モンスターカード扱いとなった「アポピスの化神」は罠カードとして扱われますが、自分の魔法＆罠ゾーンの表側表示のカードとしては扱われません。

したがって、「The despair URANUS」のモンスター効果が適用されている場合でも、モンスターカード扱いとなっている「アポピスの化神」がカードの効果によって破壊される場合には通常通り破壊される事になります。