「イグナイト・マグナム」、「イグナイト・イーグル」、「イグナイト・ドラグノフ」、「イグナイト・マスケット」、「イグナイト・ライオット」、「イグナイト・キャリバー」の『①：もう片方の自分のPゾーンに「イグナイト」カードが存在する場合に発動できる。自分のPゾーンのカードを全て破壊し、自分のデッキ・墓地から戦士族・炎属性モンスター１体を選んで手札に加える』ペンデュラム効果の発動にチェーンして「閃珖竜 スターダスト」の効果が発動しました。

その「閃珖竜 スターダスト」の効果によって、効果を発動した「イグナイト・マグナム」等自身もしくは、もう片方の自分のペンデュラムゾーンに存在する「イグナイト」と名のついたカードのどちらかが破壊されない場合、効果処理はどうなりますか？

「イグナイト・マグナム」等のペンデュラム効果は、効果を発動した自身と、もう片方のペンデュラムゾーンに存在する「イグナイト」と名のついたカードの両方を破壊する事ができなかった場合には、『自分のデッキ・墓地から戦士族・炎属性モンスター１体を選んで手札に加える』処理を適用する事ができません。

質問の状況の場合、「閃珖竜 スターダスト」の効果の対象となったペンデュラムゾーンのカードは破壊されず、そのままペンデュラムゾーンに残りますが、もう1枚のペンデュラムゾーンのカードは破壊される事になります。
（結果的にペンデュラムゾーンのカードが1枚しか破壊されていませんので、『自分のデッキ・墓地から戦士族・炎属性モンスター１体を選んで手札に加える』処理を適用する事はできません。）