自分が「聖騎士の追想 イゾルデ」の『②：デッキから装備魔法カードを任意の数だけ墓地へ送って発動できる（同名カードは１枚まで）。墓地へ送ったカードの数と同じレベルの戦士族モンスター１体をデッキから特殊召喚する』モンスター効果を発動する際に、コストとして、自分のデッキから4枚の装備魔法カードを墓地へ送りました。

その発動にチェーンして、相手が「D.D.クロウ」のモンスター効果を発動し、そのコストとして墓地へ送られた装備魔法カードのうち1枚を除外しました。

この場合、「聖騎士の追想 イゾルデ」のモンスター効果の処理はどうなりますか？

質問の状況のように、「聖騎士の追想 イゾルデ」のモンスター効果を発動する際にデッキから墓地へ送った装備魔法カードの内1枚が墓地に存在しなくなっている場合でも、効果処理は通常通り適用されます。
（質問の状況の場合、デッキから4枚の装備魔法カードを墓地へ送って発動していますので、デッキからレベル4の戦士族モンスター1体を特殊召喚する事になります。）