自分の魔法＆罠ゾーンに「機殻の再星」がセットされています。

自分フィールドに「クリフォート」と名のついたカードが１枚も存在していない場合、セットされている「機殻の再星」を発動した場合、『①：モンスターが召喚・反転召喚された時、そのモンスターがレベル４以下の場合にこの効果を発動する。そのモンスターの効果をターン終了時まで無効にする』効果や、『②：モンスターが特殊召喚された時、そのモンスターがレベル５以上の場合にこの効果を発動する。そのモンスターの効果をターン終了時まで無効にする。そのモンスターはフィールドから離れた場合に除外される』効果を適用する事はできますか？

質問の状況の場合、『③：フィールドに「機殻の再星」以外の「クリフォート」カードが存在しない場合にこのカードは墓地へ送られる』効果の条件を満たしている状態で、セットされている「機殻の再星」を発動した事になります。

「機殻の再星」のカードの発動と同一のチェーンブロックにて、モンスターの効果を無効にする効果を発動している場合でも、その効果処理が行われる前に『③：フィールドに「機殻の再星」以外の「クリフォート」カードが存在しない場合にこのカードは墓地へ送られる』処理が適用され「機殻の再星」自身が墓地へ送られる事になります。

結果的に、モンスターの効果を無効にする処理も、フィールドから離れた場合に除外される処理も適用する事はできません。