自分のペンデュラムゾーンに「クリフォート・ツール」が存在し、『①：自分は「クリフォート」モンスターしか特殊召喚できない。この効果は無効化されない』ペンデュラム効果が適用されています。

自分はこの状況で、「マジカルシルクハット」を発動する事はできますか？

「クリフォート・ツール」のペンデュラム効果が適用されている場合であっても、「マジカルシルクハット」を発動する事はできますが、その場合、自分は「クリフォート」と名のついたモンスターしか特殊召喚する事ができない状態ですので、「マジカルシルクハット」の効果でモンスターカード扱いとしてセットする事ができるのは、「機殻の生贄」や「機殻の再星」等、「クリフォート」と名のついたカードのみとなります。

（したがって、自分のデッキに「クリフォート」と名のついた魔法・罠カードが2枚存在しない場合には、「マジカルシルクハット」を発動する自体ができません。）