自分の魔法＆罠ゾーンに「オルターガイスト・プロトコル」が表側表示で存在し、『①：このカードが魔法＆罠ゾーンに存在する限り、自分フィールドの「オルターガイスト」カードの効果の発動及びその発動した効果は無効化されない』効果が適用されています。

この状況で、自分が「オルターガイスト・マリオネッター」の『①：このカードが召喚に成功した時に発動できる。デッキから「オルターガイスト」罠カード１枚を選んで自分の魔法＆罠ゾーンにセットする』モンスター効果を発動した際に、相手がチェーンして「閃刀機－ウィドウアンカー」の『①：自分のメインモンスターゾーンにモンスターが存在しない場合、フィールドの効果モンスター１体を対象として発動できる。そのモンスターの効果をターン終了時まで無効にする。その後、自分の墓地に魔法カードが３枚以上存在する場合、そのモンスターのコントロールをエンドフェイズまで得る事ができる』効果を発動し、その「オルターガイスト・マリオネッター」を対象とした場合、効果処理はどうなりますか？

質問の状況の場合、「閃刀機－ウィドウアンカー」の効果処理は通常通り適用され、「オルターガイスト・マリオネッター」のモンスター効果は無効になり、コントロールが相手に移りますが、「オルターガイスト・プロトコル」の効果が適用されていますので、既に発動した「オルターガイスト・マリオネッター」の『デッキから「オルターガイスト」罠カード１枚を選んで自分の魔法＆罠ゾーンにセットする』処理自体は無効化されずに適用される事になります。